1.認證對象不同。
　　產品質量認證的對象是批量生產的定型產品，質量體系認證的對象是企業的質量體系，確切地說，是“企業質量體系中影響持續按需方的要求提出產品或服務的能力和某些要素”，即質量保證體系。
　　2.證明的方式不同。
　　產品質量的認證的證明方式是產品認證證書及產品認證標志，證書和標志證明產品質量符合產品標準，質量體系認證的證明方式是質量體系認證證書和體系認證標記，證書和標記只證明該企業的質量體系符合某一質量保證標準，不證明該企業生產的任何產品符合產品標準。
　　3.證明的使用的區別。
　　產品質量認證證書不能用于產品，標志可用于獲準認證的產品上，質量體系認證證書和標記都不能在產品上使用。
　　4.實施質量體系審核的依據不同。
　　產品質量認證一般按GB/T 19002-ISO 9002檢查體系；質量體系認證依據審核企業要求，可能是GB/T 19001-ISO 9001、GB/T 19002-ISO 9002、GB/T 19003-ISO 9003其中之一。如果企業具有產品設計/開發功能，同時又希望對外承攬設計任務，可申請GB/T 19001-ISO 9001的體系認證，如果企業雖然具備設計/開發功能，但不對外承攬設計任務，或者沒有設計功能，但產品的制造比較復雜，可申請GB/T 19002-ISO 9002的體系認證，如果企業生產的產品十分簡單，則申請GB/T 19003-ISO 9003的體系認證。
　　5.申請企業類型不同。
　　要求申請產品質量認證的企業是生產特定的產品型企業，申請質量體系認證的企業可以是生產、安裝型企業，可以是設計/開發、制造、安裝服務型企業，也可以是出廠檢查和檢驗型企業。
　　綜上所述，產品質量認證與質量體系認證既有區別，又互相利用。企業只有清楚了解了兩類認證的區別和互相關系，以確定應該實施產品認證，還是應該實施質量體系認證。